دبیرستان علوم و معارف اسلامی نیز دانش آموزان خود را از میان دارندگان صلاحیت های علمی و اخلاقی از طریق آزمون ورودی و مصاحبه انتخاب می کنند. آزمون مذکور بصورت هماهنگ در سراسر کشور برگزار می شود.

 مواد آزمون ورودی دبیرستانهای علوم و معارف اسلامی عبارتند از : تعلیمات دینی، عربی، ریاضی، زبان انگلیسی، ادبیات فارسی